Las escuelas son las áreas ejecutoras de los programas de estudio de las carreras dictadas en la facultad. Actualmente la Facultad de Ciencias Económicas se divide en tres escuelas:

Escuela de Economía Director :  Prof. Econ. Nilfa Melgarejo de Rojas Carrera : Economía Escuela de Administración Director : Prof. Dra. Dora Ramírez de Colmán Carrera : Administración Escuela de Contabilidad Director :  Prof. Dr. J. Marcos Lezcano Bernal Carrera : Contaduría Pública

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